Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20604F8WIA3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20604F8WIA3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms