Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pira2F8VQ94 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pira2F8VQ94 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms