Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r76F8VQ63 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r76F8VQ63 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms