Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28048F7BCN0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28048F7BCN0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms