Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms