Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms