Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8220F6YKI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8220F6YKI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms