Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21977F6U3N7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms