Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17lbE9Q9U0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms