Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd35E9Q9D8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd35E9Q9D8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms