Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Urb2E9Q7L1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Urb2E9Q7L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Urb2E9Q7L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms