Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Simc1E9Q6E9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Simc1E9Q6E9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms