Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtproE9Q612 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtproE9Q612 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtproE9Q612 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms