Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdc1E9Q5K9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms