Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17175E9Q528 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17175E9Q528 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms