Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms