Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tarbp1E9Q368 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tarbp1E9Q368 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tarbp1E9Q368 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms