Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd2E9Q1M1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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