Protein–RNA interactions for Protein: E9Q069

Vmn1r157, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r157E9Q069 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r157E9Q069 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r157E9Q069 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms