Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms