Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brd1E9PZ26 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brd1E9PZ26 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd1E9PZ26 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms