Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph10bE9PYQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph10bE9PYQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms