Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbf2E9PXF8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sbf2E9PXF8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbf2E9PXF8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms