Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931408C20RikE9PWP9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms