Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG4

Crisp4, Cysteine-rich secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp4E9PVG4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Crisp4E9PVG4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms