Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit3bE9PV48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms