Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syde2E9PUP1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syde2E9PUP1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms