Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930444G20RikD3Z741 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4930444G20RikD3Z741 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms