Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
5430403G16RikD3Z5L4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5430403G16RikD3Z5L4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms