Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5934D3Z4U6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5934D3Z4U6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms