Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptrhd1D3Z4S3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptrhd1D3Z4S3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptrhd1D3Z4S3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptrhd1D3Z4S3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms