Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc8D3YZV8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc8D3YZV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms