Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif28pD3YXS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms