Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn24D3YXJ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn24D3YXJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms