Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms