Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms