Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1bB9EJ57 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mterf1bB9EJ57 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms