Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms