Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11cB4XVP9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms