Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26c1B2RXA7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms