Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU015836B2RUM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms