Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apba1B2RUJ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apba1B2RUJ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apba1B2RUJ5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apba1B2RUJ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms