Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otud4B2RRE7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud4B2RRE7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms