Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf3B2RQG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms