Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms