Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms