Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Odf2A3KGV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf2A3KGV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms