Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930402F06RikA2AUQ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930402F06RikA2AUQ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms