Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upf2A2AT37 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upf2A2AT37 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Upf2A2AT37 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms