Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef17A2ASJ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef17A2ASJ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms